Criando Seu Próprio Script no after

// Script com janela de interface
(function(thisObj) {

    function buildUI(thisObj) {
        var panel = (thisObj instanceof Panel) ?
            thisObj : new Window("palette", "Meu Script", undefined);

        panel.orientation = "column";
        panel.margins = 10;

        // Campo de texto
        var labelGroup = panel.add("group");
        labelGroup.add("statictext", undefined, "Prefixo:");
        var prefixInput = labelGroup.add("edittext", undefined, "Element_");
        prefixInput.characters = 15;

        // Botão
        var runBtn = panel.add("button", undefined, "Executar");
        runBtn.onClick = function() {
            runScript(prefixInput.text);
        };

        if (panel instanceof Window) {
            panel.center();
            panel.show();
        } else {
            panel.layout.layout(true);
        }

        return panel;
    }

    function runScript(prefix) {
        var comp = app.project.activeItem;

        if (!comp || !(comp instanceof CompItem)) {
            alert("Selecione uma composição.");
            return;
        }

        var selected = comp.selectedLayers;
        if (selected.length === 0) {
            alert("Selecione ao menos uma layer.");
            return;
        }

        app.beginUndoGroup("Renomear com prefixo");
        for (var i = 0; i < selected.length; i++) {
            selected[i].name = prefix + ("00" + (i + 1)).slice(-2);
        }
        app.endUndoGroup();

        alert(selected.length + " layers renomeadas.");
    }

    buildUI(thisObj);

})(this);

app.beginUndoGroup("Nome descritivo");
// modificações
app.endUndoGroup();

var comp = app.project.activeItem;
if (!comp || !(comp instanceof CompItem)) {
    alert("Selecione uma composição primeiro.");
    exit();
}